La Coordinación de Deportes se crea el 1986, bajo la dependencia de Secretaria General. Los propósitos fueron varios, todos ellos dirigidos a enriquecer la vida estudiantil universitaria y promover los beneficios a la salud desde la práctica deportiva. En ese sentido, la UPSA incentiva al deporte como un mecanismo de desarrollo integral de la persona, reconociéndolo como un medio para la liberación de las tensiones generadas por las exigencias de los estudios y el ritmo de vida actual. La continuidad y consolidación de los hábitos de la práctica deportiva también permite afianzar la identificación del estudiante con su carrera y del graduado con la UPSA, fortaleciendo la integración entre los diferentes niveles y facultades, consolidando la comunidad universitaria.

Desde la fundación, la Unidad de Deportes ha estado a cargo de la organización de uno de los eventos más reconocidos por los estudiantes de colegio, la Copa UPSA, y ha impulsado el desarrollo competitivo de los equipos de la Universidad en diversas disciplinas.